高等学校化学学报 ›› 2011, Vol. 32 ›› Issue (12): 2877.
霍红洁, 赵东霞, 杨忠志
HUO Hong-Jie, ZHAO Dong-Xia*, YANG Zhong-Zhi*
摘要: 选取氮甲基乙酰胺(N-Methylacetamide, NMA)和DNA碱基为研究对象, 应用ABEEMσπ/MM方法研究了NMA与碱基之间形成的二聚体的几何构型、电荷分布及结合能等性质, 并进行了相应的从头算(ab initio)MP2水平研究, 在B3LYP/6-311++G(d,p)水平下对结构进行了优化. 将2种方法的研究结果进行比较发现, 所获得的构型、电荷及结合能之间具有很好的一致性, NMA与DNA碱基相互作用的强度大小依次为: 鸟嘌呤>胸腺嘧啶>胞嘧啶>腺嘌呤, 且证明了ABEEMσπ/MM模型的参数具有很好的可转移性.
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