促红细胞生成素(EPO)受体(EBP)激活剂的理论突变设计

高等学校化学学报

促红细胞生成素(EPO)受体(EBP)激活剂的理论突变设计

齐岩峰¹, 高雪峰¹, 黄旭日²

1. 吉林大学生命科学学院,
2. 理论化学研究所, 理论化学计算国家重点实验室, 长春 130021

收稿日期:2006-09-23 修回日期:2007-06-20 出版日期:2008-03-10 发布日期:2008-03-10
通讯作者: 高雪峰

Theoretical Mutation Design of Active Agent of Eryhropoietin and Its Receptor

QI Yan-Feng¹, GAO Xue-Feng¹*, HUANG Xu-Ri²

1. College of Life Science,
2. State Key Laboratory of Theoretical and Computational Chemistry, Institute of Theoretical Chemistry, Jilin University, Changchun 130021, China

Received:2006-09-23 Revised:2007-06-20 Online:2008-03-10 Published:2008-03-10
Contact: GAO Xue-Feng

摘要/Abstract

摘要： 采用分子动力学模拟的方法, 构建了人促红细胞生成素模拟肽与其受体胞外结合片段的相互作用的分子动力学模型. 通过对该模型的结构研究和理论分析, 对模拟肽与受体结合机制提出了新的理论解释. 根据EBP活性口袋的静电势分布, 对二聚体小肽激活剂的每条链上的部分氨基酸进行了突变, 分别用电性更强的氨基酸来代替部分疏水氨基酸, 计算结果显示, 突变后的二聚体小肽激活剂对EBP的“亲和力”明显增强.

关键词: 促红细胞生成素, 模拟肽, 分子动力学模拟

Abstract: Methods of molecular dynamics simulations were used to investigate the structure, dynamics and thermodynamics of the known complex between erythropoietin mimetic peptides(EMPs) and erythropoietin receptor(EpoR). On the basis of these results, we designed new kinds of EMPs that has proposed significance in binding toreceptor. We used amino acid residues which have more electricity ability to replace the hydrophobic ones. According to our calculation results, the mutant type peptide has more binding ability to the EpoR. Our results illustrate a principle for fast identifying receptor-specific site important for receptor interralization, and for enhancing sensitivity to horm on and other agonist.

Key words: Erythropoietin, Mimetic peptide, Molecular dynamic simulation

中图分类号:

O641

TrendMD:

齐岩峰,高雪峰,黄旭日 .

促红细胞生成素(EPO)受体(EBP)激活剂的理论突变设计

. 高等学校化学学报, doi: .

QI Yan-Feng¹, GAO Xue-Feng¹*, HUANG Xu-Ri². Theoretical Mutation Design of Active Agent of Eryhropoietin and Its Receptor. Chem. J. Chinese Universities, doi: .

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