Slc11a2第六跨膜区在十二烷基磷酰胆碱胶束中的结构

doi:10.7503/cjcu20160884

高等学校化学学报 ›› 2017, Vol. 38 ›› Issue (9): 1596.doi: 10.7503/cjcu20160884

Slc11a2第六跨膜区在十二烷基磷酰胆碱胶束中的结构

肖淑艳¹, 李菲², 董忠平¹()

1. 内蒙古科技大学材料与冶金学院, 包头 014010
2. 吉林大学超分子结构与材料国家重点实验室, 长春 130012

收稿日期:2016-12-07 出版日期:2017-09-10 发布日期:2017-08-25
作者简介:联系人简介: 董忠平, 男, 博士, 讲师, 主要从事蛋白质谱学研究. E-mail: dzp05291128@163.com
基金资助:
国家自然科学基金(批准号: 21663017)、内蒙古自治区自然科学基金(批准号: 2015BS0205)、内蒙古自治区草原英才基金(批准号: CYYC2013173)和内蒙古科技大学创新基金(批准号: 2014QDL017)资助

Solution Structure of Slc11a2-TM6 in Dodecylphosphocholine Micelles^†

XIAO Shuyan¹, LI Fei², DONG Zhongping^1,^*()

1. School of Materials and Metallurgy, Inner Mongolia University of Science and Technology, Baotou 014010, China
2. State Key Laboratory of Supramolecular Structure and Materials, Jilin University, Changchun 130012, China

Received:2016-12-07 Online:2017-09-10 Published:2017-08-25
Contact: DONG Zhongping E-mail:dzp05291128@163.com
Supported by:
† Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.21663017), the Natural Science Foundation of Inner Mongolia, China(No.2015BS0205), the Grassland Talent Foundation of Inner Mongolia, China(No.CYYC2013173) and the Inner Mongolia University of Science and Technology Innovation Fund, China(No.2014QDL017)

摘要/Abstract

摘要：

采用圆二色谱和核磁共振波谱研究了Slc11a2第六跨膜区在十二烷基磷酰胆碱(DPC)膜模拟环境中的结构和定位. 结果表明, Slc11a2第六跨膜区在DPC胶束中N端和C端各形成一小段α螺旋, 两段螺旋中间通过高度灵活的区域连接, 整个肽插入到DPC胶束中. H267A突变使螺旋长度变长, H272A突变使螺旋长度略有变短, 突变后结构的变化可能和蛋白功能缺失相关.

关键词: Slc11a2第六跨膜区, 核磁共振, 三维结构

Abstract:

The structure of isolated peptides from TM6 of Slc11a2 in dodecylphosphocholine(DPC) micelles was investigated using circular dichroism(CD) and nuclear magnetic resonance(NMR) spectroscopy. The results reveal that TM6 of Slc11a2 forms short α-helix in both N- and C-terminal and the two α-helixes are connected by a highly flexible region, the whole peptide is embedded in DPC micelles. H267A mutation makes the helix become longer, while H272A mutation make the helix become slightly shorter.

Key words: Slc11a2-TM6, Nuclear magnetic resonance, 3D structure(Ed.: S, Z, M)

中图分类号:

O629.7

TrendMD:

肖淑艳, 李菲, 董忠平. Slc11a2第六跨膜区在十二烷基磷酰胆碱胶束中的结构. 高等学校化学学报, 2017, 38(9): 1596.

XIAO Shuyan, LI Fei, DONG Zhongping. Solution Structure of Slc11a2-TM6 in Dodecylphosphocholine Micelles^†. Chem. J. Chinese Universities, 2017, 38(9): 1596.

图/表 5

Fig.1 CD spectra of Slc11a2-TM6(a), H267A(b) and H272A(c) in DPC micelles at pH=4.12 and room temperature

Fig.2 Hα-HN region of 2D NOESY spectra of Slc11a2-TM6 in 90%H2O/10%D2O, 298 K(A), Hα-HN region of 2D NOESY spectra(B), the NOE connectivities(C) and secondary structure shift(D) of Slc11a2-TM6 in the presence of 240 mmol/L DPC-d38 at pH=4.12 and 298 K

Fig.3 Ensemble of backbone atoms of 10 best structures(A) and ribbon representation of the mean

Table 1 Structural statistics of Slc11a2-TM6 in DPC-d38 micelles at pH=4.12 and 298 K

Deviations from idealized geometry	Bond lengths/nm	0.0005
	Bond angles/(°)	0.4
RMSD values(All residues)	Backbone heavy atoms/nm	0.21
	All heavy atoms/nm	0.28
RMSD values(well-defined residues^*)	Backbone heavy atoms/nm	0.01
	All heavy atoms/nm	0.06
Ramachandran plot statistics(well-defined residues^*)	Residues in most favored region(%)	100.0
	Residues in additionally allowed region(%)	0
	Residues in generously allowed region(%)	0
	Residues in disallowed region(%)	0

Fig.4 Effects of Mn2+ ions on the resonance intensities of Slc11a2-TM6 in DPC-d38 micelles at 298 K

参考文献 33

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