DNA与目标分子相互作用的预测性研究

高等学校化学学报

DNA与目标分子相互作用的预测性研究

王岚, 耿再新, 卢小泉, 刘宏德, 王睿, 陈晶

西北师范大学化学化工学院, 兰州 730070

收稿日期:2006-02-28 修回日期:1900-01-01 出版日期:2007-01-10 发布日期:2007-01-10
通讯作者: 卢小泉

Predictive Studies on Interaction Between DNA and Target Molecules

WANG Lan, GENG Zai-Xin, LU Xiao-Quan, LIU Hong-De, WANG Rui, CHEN Jing

College of Chemistry and Chemical Engineering, Northwest Normal University, Lanzhou 730070, China

Received:2006-02-28 Revised:1900-01-01 Online:2007-01-10 Published:2007-01-10
Contact: LU Xiao-Quan

摘要/Abstract

摘要： 以量化的分子结构参数和实验结果为依据, 运用模式识别技术、多元线性回归和人工神经网络研究了目标分子与DNA相互作用的主要影响因素, 建立了准确性较高的2个键合常数预测模型和1个作用模式预测模型. 初次量化的分子结构参数有21种, 经过筛选发现其中的10种参数对相互作用有显著影响. 研究结果可为抗癌药物的分子设计和筛选提供有价值的信息.

关键词: DNA, 相互作用, 主成分分析, 人工神经网络

Abstract: On the basis of the quantified data of molecular structures and the experimental results, the pattern recognition techniques, multiple linear regression and artificial neural network were applied to studying the main influencing factors for the interaction between DNA and the target molecules, and two predictable models of binding constant and one binding mode which have a high accurate were established. First, 21 structural descriptors(parameters) were used to describe a target molecule. After filtering, 10 descriptors were found to affect remarkably the interaction between the target molecules and DNA. These studies could afford valuable information to design and filter molecules of anticancer drugs.

Key words: DNA, Interaction, Principle component analysis, Artificial neutral networks

中图分类号:

TrendMD:

王岚, 耿再新, 卢小泉, 刘宏德, 王睿, 陈晶 . DNA与目标分子相互作用的预测性研究. 高等学校化学学报, doi: .

WANG Lan, GENG Zai-Xin, LU Xiao-Quan, LIU Hong-De, WANG Rui, CHEN Jing. Predictive Studies on Interaction Between DNA and Target Molecules. Chem. J. Chinese Universities, doi: .

[1]	任诗杰, 谯思聪, 刘崇静, 张文华, 宋礼. 铂单原子催化剂同步辐射X射线吸收谱的研究进展[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(9): 20220466.
[2]	刘苏毓, 丁飞, 李茜, 樊春海, 冯景. 偶氮苯类DNA纳米机器[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(8): 20220122.
[3]	仵宇帅, 尚颖旭, 蒋乔, 丁宝全. 可控自组装DNA折纸结构作为药物载体的研究进展[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(8): 20220179.
[4]	周雷雷, 程海洋, 赵凤玉. Pd基多相催化剂上CO₂加氢反应的研究进展[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(7): 20220279.
[5]	黄明心, 周蕾, 王学重. 超声衰减谱测量电池浆料的粒度分布[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(6): 20220040.
[6]	王君旸, 刘争, 张茜, 孙春燕, 李红霞. DNA银纳米簇在功能核酸荧光生物传感器中的应用[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(6): 20220010.
[7]	胡慧敏, 崔静, 刘丹丹, 宋佳欣, 张宁, 范晓强, 赵震, 孔莲, 肖霞, 解则安. 过渡金属修饰对Pt/M-DMSN催化剂丙烷脱氢性能的影响[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(4): 20210815.
[8]	刘洋, 李旺昌, 张竹霞, 王芳, 杨文静, 郭臻, 崔鹏. Sc₃C₂@C₈₀与[12]CPP纳米环之间非共价相互作用的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(11): 20220457.
[9]	姜珊, 申倩倩, 李琦, 贾虎生, 薛晋波. Pd增强缺陷态TiO₂纳米管阵列的光催化产氢性能[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(10): 20220206.
[10]	许文哲, 张皓. 超分子相互作用主导的纳米药物成核[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(10): 20220264.
[11]	温炜, 黄达锭, 鲍劲霄, 张增辉. PD-1与单克隆抗体残基特异性结合机制的计算丙氨酸扫描研究[J]. 高等学校化学学报, 2021, 42(7): 2161.
[12]	吴杨仪, 陈建平, 艾益静, 汪庆祥, 高飞, 高凤. 2-(2-羟基-3-甲氧基苯基)-C₆₀的合成及在花椰菜花叶病毒启动子DNA传感检测中的应用[J]. 高等学校化学学报, 2021, 42(6): 1754.
[13]	马卓远, 汪大洋. 分子自组装单层膜的表面浸润性研究现状和展望[J]. 高等学校化学学报, 2021, 42(4): 1031.
[14]	王昱芃, 赵洋, 李茉涵, 史素青, 宫永宽. 多巴胺基多重相互作用协同构筑抗污-杀菌双重功能涂层[J]. 高等学校化学学报, 2021, 42(3): 811.
[15]	李梦硕, 张静, 刘丹, 朱亚先, 张勇. 芘与人血清白蛋白和牛血清白蛋白结合位点微环境极性的差异[J]. 高等学校化学学报, 2021, 42(3): 731.