CPSA与疏水性参数的遗传算法及神经网络法研究

高等学校化学学报 ›› 2000, Vol. 21 ›› Issue (1): 41.

CPSA与疏水性参数的遗传算法及神经网络法研究

郭明, 刘文杰, 徐尊

塔里木农垦大学基础课部, 阿拉尔 843300

收稿日期:1999-04-29 出版日期:2000-01-24 发布日期:2000-01-24
通讯作者: 郭　明(1967年出生),男,硕士,副教授,主要从事化学计量学研究.
基金资助:
国家自然科学基金(批准号:29767001);新疆生产建设兵团科学技术委员会科研基金

Studies on the QSPR Between Charged Partial Surface Area and lgP of Organic Compounds Using Genetic Algorithm and Neural Network

GUO Ming, LIU Wen-Jie, XU Zun

Department of Basic Course, Tarim University of Agricultural Reclamation, Alar 843300, China

Received:1999-04-29 Online:2000-01-24 Published:2000-01-24

摘要/Abstract

摘要： 用分子力学计算出“净”原子表面积,并利用量子化学方法计算出化合物的电荷加权部分表面积(CP-SA).在用遗传算法和神经网络法对改进的CPSA与有机醇类化合物的疏水性参数作相关分析时发现,改进的CPSA可有效地用于构效关系研究,且算法简洁易行,两种多元统计方法均得到了满意的结果.

关键词: 电荷加权部分表面积, lgP, 醇类, 遗传算法, 神经网络法

Abstract: The original calculation methods of Charged Partial Surface Area(CPSA) are very complex because of considering many factors of environment, the calculation about the contribution in surface area of atom to molecular in these methods are solvent accessible area. In this paper, we improved the algorithm of CPSA and calculated the “nickel” surface area of atom using molecular mechanics and the CPSA of compounds by quantum chemistry. The satisfactory result of correlation analyze between lgP and improved CPSA of alcohol demonstrates that our algorithm is simple and effective, both genetic algorithm and neural network are well used in this research.

Key words: Charged partial surface area, lgP, Alcohol, Genetic algorithm, Neural network

中图分类号:

O6271

TrendMD:

郭明, 刘文杰, 徐尊. CPSA与疏水性参数的遗传算法及神经网络法研究. 高等学校化学学报, 2000, 21(1): 41.

GUO Ming, LIU Wen-Jie, XU Zun . Studies on the QSPR Between Charged Partial Surface Area and lgP of Organic Compounds Using Genetic Algorithm and Neural Network. Chem. J. Chinese Universities, 2000, 21(1): 41.

[1]	黄明心, 周蕾, 王学重. 超声衰减谱测量电池浆料的粒度分布[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(6): 20220040.
[2]	孙金时, 陈鹏, 景丽萍, 孙福兴, 刘佳. 多级孔芳香骨架材料的合成及固载硫脲催化剂的研究[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(10): 20220171.
[3]	徐艳, 杨宏国, 牛慧斌, 田海林, 朴红光, 黄应平, 方艳芬. 磁性纳米颗粒Fe₃O₄的醇改性制备机理及应用[J]. 高等学校化学学报, 2021, 42(8): 2564.
[4]	肖永坤, 刘春莹, 鱼红闪, 李泰厚, 徐龙权, 宋建国, 林完泽, 孙长凯, 金凤燮. 人参二醇类皂苷的生物转化动态及人参稀有皂苷C-K或F₂的制备[J]. 高等学校化学学报, 2019, 40(6): 1184.
[5]	张汇, 何玉韩, 唐铎, 李彦威. 基于径向基神经网络和遗传算法的槽内式选择性超声电合成甲基苯甲醛[J]. 高等学校化学学报, 2014, 35(6): 1199.
[6]	孟凡欣, 郭伟良, 逯家辉, 杜林娜, 李又欣, 滕利荣. 纤维堆囊菌发酵液中埃博霉素含量的HPLC法分析[J]. 高等学校化学学报, 2009, 30(10): 1960.
[7]	袁琳,马娟,王婷,李国红,沈月毛,赵沛基 . 云南美登木内生真菌Phomopsis sp. Lz42的化学成分[J]. 高等学校化学学报, 2009, 30(1): 78.
[8]	苏振强,,HONG Hui-Xiao,TONG Wei-Da,PERKINS Roger,邵学广,蔡文生,. 不相交主成分分析(PCA)和遗传算法(GA)用于差异表达基因的识别 [J]. 高等学校化学学报, 2007, 28(9): 1640.
[9]	王俊, 许禄 . 手性分子与手性拓扑指数[J]. 高等学校化学学报, 2007, 28(1): 46.
[10]	熊建辉, 张普敦, 石先哲, 张玉奎, 许国旺. 基于遗传算法的手性毛细管电泳分离中多指标同时优化[J]. 高等学校化学学报, 2004, 25(5): 896.
[11]	陈貌连, 宋凤瑞, 郭明全, 刘志强, 刘淑莹. 刺五加叶中黄酮类化合物的结构鉴定[J]. 高等学校化学学报, 2002, 23(5): 805.
[12]	邵学广, 孙莉. 免疫-遗传算法用于混合物重叠核磁共振信号解析[J]. 高等学校化学学报, 2001, 22(4): 552.
[13]	周向东, 李通化, 边防, 钱君律. 遗传算法与遗传编程的联用[J]. 高等学校化学学报, 2000, 21(2): 216.
[14]	刘月启, 葛永辉, 蔡青松, 蒋生祥, 陈立仁, 常俊标. 〆,β-联苯双酯对映体在纤维素类手性固定相上的高效液相色谱法直接拆分——流动相改性剂对保留时间和立体选择性的影响[J]. 高等学校化学学报, 2000, 21(12): 1828.
[15]	刘平, 程翼宇. 辨识药物定量构效关系的模糊神经网络方法研究[J]. 高等学校化学学报, 2000, 21(10): 1473.