Chem. J. Chinese Universities ›› 2020, Vol. 41 ›› Issue (6): 1127.doi: 10.7503/cjcu20190663
• Review • Previous Articles Next Articles
LIANG Yuxin,ZHAO Rong,LIANG Xinyue,FANG Xiaohong*()
Received:
2019-12-13
Online:
2020-06-10
Published:
2020-03-23
Contact:
Xiaohong FANG
E-mail:xfang@iccas.ac.cn
Supported by:
CLC Number:
TrendMD:
LIANG Yuxin, ZHAO Rong, LIANG Xinyue, FANG Xiaohong. Single-molecule Imaging and Analysis of Signal Transduction Proteins on Cell Membranes [J]. Chem. J. Chinese Universities, 2020, 41(6): 1127.
[1] |
Balazsi G., van Oudenaarden A., Collins J. J., Cell, 2011, 144(6), 910—925
doi: 10.1016/j.cell.2011.01.030 URL |
[2] |
Sever R., Brugge J. S., Cold Spring Harb. Perspect. Med., 2015, 5(4), a006098
doi: 10.1101/cshperspect.a006098 URL |
[3] |
Insel P. A., Sriram K., Wiley S. Z., Wilderman A., Katakia T., McCann T., Yokouchi H., Zhang L., Corriden R., Liu D., Feigin M. E., French R. P., Lowy A. M., Murray F., Front. Pharmacol., 2018, 9, 1—11
doi: 10.3389/fphar.2018.00001 URL |
[4] |
Lemmon M. A., Schlessinger J., Cell, 2010, 141(7), 1117—1134
doi: 10.1016/j.cell.2010.06.011 URL |
[5] |
Calebiro D., Sungkaworn T., Trends Pharmacol. Sci., 2018, 39(2), 109—122
doi: 10.1016/j.tips.2017.10.010 URL |
[6] |
Elf J., Barkefors I., Annu. Rev. Biochem., 2019, 88, 635—659
doi: 10.1146/annurev-biochem-013118-110801 URL |
[7] |
Sako Y., Minoguchi S., Yanagida T., Nat. Cell Biol., 2000, 2(3), 168—172
doi: 10.1038/35004044 URL |
[8] |
Schutz G. J., Kada G., Pastushenko V. P., Schindler H., Embo J., 2000, 19(5), 892—901
doi: 10.1093/emboj/19.5.892 URL |
[9] |
Li N., Zhao R., Sun Y., Ye Z., He K. M., Fang X. H., Natl. Sci. Rev., 2017, 4(5), 739—760
doi: 10.1093/nsr/nww055 URL |
[10] |
Thompson N. L., Pearce K. H., Hsieh H. V., Eur. Biophys. J. Biophys. Lett., 1993, 22(5), 367—378
doi: 10.1007/BF00213560 URL |
[11] |
Demuro A., Parker I., Biophys. J., 2004, 86(5), 3250—3259
doi: 10.1016/S0006-3495(04)74373-8 URL |
[12] |
Zhang W., Jiang Y. X., Wang Q., Ma X. Y., Xiao Z. Y., Zuo W., Fang X. H., Chen Y. G., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2009, 106(37), 15679—15683
doi: 10.1073/pnas.0908279106 URL |
[13] |
Konopka C. A., Bednarek S. Y., Plant J., 2008, 53(1), 186—196
doi: 10.1111/tpj.2008.53.issue-1 URL |
[14] | Tokunaga M., Imamoto N., Sakata-Sogawa K., Nat. Methods, 2008, 5(2), 159—161 |
[15] |
Luo W. X., Xia T., Xu L., Chen Y. G., Fang X. H., J. Biophotonics, 2014, 7(10), 788—798
doi: 10.1002/jbio.201300020 URL |
[16] |
Fu Y., Winter P. W., Rojas R., Wang V., McAuliffe M., Patterson G. H., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2016, 113(16), 4368—4373
doi: 10.1073/pnas.1516715113 URL |
[17] |
Sigal Y. M., Zhou R. B., Zhuang X. W., Science, 2018, 361(6405), 880—887
doi: 10.1126/science.aau1044 URL |
[18] |
Zhou R. B., Han B. R., Xia C. L., Zhuang X. W., Science, 2019, 365(6456), 929—934
doi: 10.1126/science.aaw5937 URL |
[19] |
Inavalli V. V. G. K., Lenz M. O., Butler C., Angibaud J., Compans B., Levet F., Tonnesen J., Rossier O., Giannone G., Thoumine O., Hosy E., Choquet D., Sibarita J. B., Nagerl U. V., Nat. Methods, 2019, 16(12), 1263—1268
doi: 10.1038/s41592-019-0611-8 URL |
[20] |
Nerreter T., Letschert S., Goetz R., Doose S., Danhof S., Einsele H., Sauer M., Hudecek M., Nat. Commun., 2019, 10, 1—11
doi: 10.1038/s41467-018-07882-8 URL |
[21] |
Qin G. G., Li W. H., Xu J. C., Kou X. L., Zhao R., Luo F., Fang X. H., Chin. J. Anal. Chem., 2017, 45(12), 1813—1822
doi: 10.1016/S1872-2040(17)61056-9 URL |
[22] |
Cranfill P. J., Sell B. R., Baird M. A., Allen J. R., Lavagnino Z., de Gruiter H. M., Kremers G. J., Davidson M. W., Ustione A., Piston D. W., Nat. Methods, 2016, 13(7), 557—562
doi: 10.1038/nmeth.3891 URL |
[23] | Bajar B. T., Lam A. J., Badiee R. K., Oh Y. H., Chu J., Zhou X. X., Kim N., Kim B. B., Chung M., Yablonovitch A. L., Cruz B. F., Kulalert K., Tao J. J., Meyer T., Su X. D., Lin M. Z., Nat. Methods, 2016, 13(12), 993—996 |
[24] | Shaner N. C., Lambert G. G., Chammas A., Ni Y., Cranfill P. J., Baird M. A., Sell B. R., Allen J. R., Day R. N., Israelsson M., Davidson M. W., Wang J., Nat. Methods, 2013, 10(5), 407—409 |
[25] |
Bajar B. T., Wang E. S., Lam A. J., Kim B. B., Jacobs C. L., Howe E. S., Davidson M. W., Lin M. Z., Chu J., Sci. Rep., 2016, 6(1), 20889
doi: 10.1038/srep20889 URL |
[26] |
Bindels D. S., Haarbosch L., van Weeren L., Postma M., Wieser K. E., Mastop M., Aumonier S., Gotthard G., Royant A., Hink M. A., Gadella T. W. J. J., Nat. Methods, 2017, 14(1), 53—56
doi: 10.1038/nmeth.4074 URL |
[27] |
Ran F. A., Hsu P. D., Lin C. Y., Gootenberg J. S., Konermann S., Trevino A. E., Scott D. A., Inoue A., Matoba S., Zhang Y., Zhang F., Cell, 2013, 154(6), 1380—1389
doi: 10.1016/j.cell.2013.08.021 URL |
[28] | Jinek M., Chylinski K., Fonfara I., Hauer M., Doudna J. A., Charpentier E., Science, 2012, 337(6096), 816—821 |
[29] | Tasan I., Sustackova G., Zhang L. G., Kim J., Sivaguru M., HamediRad M., Wang Y. C., Genova J., Ma J., Belmont A. S., Zhao H. M., Nucleic Acids Res., 2018, 46(17), e100 |
[30] | Wang S. X., Cao J., Cheng Y. X., Lu C. H., Chem. Res. Chinese Universities, 2019, 35(6), 967—971 |
[31] | Xu G. P., Tang Y. H., Lin W. Y., Chem. Res. Chinese Universities, 2018, 34(4), 523—527 |
[32] | Liu Z., Lavis L. D., Betzig E., Mol. Cell, 2015, 58(4), 644—659 |
[33] |
Hughes L. D., Rawle R. J., Boxer S. G., PLoS One, 2014, 9(2), e87649
doi: 10.1371/journal.pone.0087649 URL |
[34] | Grimm J. B., English B. P., Choi H., Muthusamy A. K., Mehl B. P., Dong P., Brown T. A., Lippincott-Schwartz J., Liu Z., Lionnet T., Lavis L. D., Nat. Methods, 2016, 13(12), 985—988 |
[35] | Karch S., Broichhagen J., Schneider J., Boening D., Hartmann S., Schmid B., Tripal P., Palmisano R., Alzheimer C., Johnsson K., Huth T., J. Med. Chem., 2018, 61(14), 6121—6139 |
[36] | Los G. V., Encell L. P., McDougall M. G., Hartzell D. D., Karassina N., Zimprich C., Wood M. G., Learish R., Ohane R. F., Urh M., Simpson D., Mendez J., Zimmerman K., Otto P., Vidugiris G., Zhu J., Darzins A., Klaubert D. H., Bulleit R. F., Wood K. V., ACS Chem. Biol., 2008, 3(6), 373—382 |
[37] | Gautier A., Juillerat A., Heinis C., Correa I. R. J., Kindermann M., Beaufils F., Johnsson K., Chem. Biol., 2008, 15(2), 128—136 |
[38] |
Plass T., Milles S., Koehler C., Szymanski J., Mueller R., Wiessler M., Schultz C., Lemke E. A., Angew. Chem. Int. Ed., 2012, 51(17), 4166—4170
doi: 10.1002/anie.201108231 URL |
[39] | Nikic I., Plass T., Schraidt O., Szymanski J., Briggs J. A. G., Schultz C., Lemke E. A., Angew. Chem. Int. Ed., 2014, 53(8), 2245—2249 |
[40] | Cheng M., Zhang W., Yuan J. H., Luo W. X., Li N., Lin S. X., Yang Y., Fang X. H., Chen P. R., Chem. Commun., 2014, 50(94), 14724—14727 |
[41] | Devaraj N. K., Hilderbrand S., Upadhyay R., Mazitschek R., Weissleder R., Angew. Chem. Int. Ed., 2010, 49(16), 2869—2872 |
[42] | Wang L., Zong S. F., Wang Z. Y., Lu J., Chen C., Zhang R. H., Cui Y. P., Nanotechnology, 2018, 29(28), 285602 |
[43] | Vu T. Q., Lam W. Y., Hatch E. W., Lidke D. S., Cell Tissue Res., 2015, 360(1), 71—86 |
[44] | Liu H. F., Li Z. H., Sun Y. Q., Geng X., Hu Y. L., Meng H. M., Ge J., Qu L. B., Sci. Rep., 2018, 8, 1086 |
[45] | Li D. Y., Qin W., Xu B., Qian J., Tang B. Z., Adv. Mater., 2017, 29(43), 1703643 |
[46] | Haziza S., Mohan N., Loe-Mie Y., Lepagnol-Bestel A. M., Massou S., Adam M. P., Le X. L., Viard J., Plancon C., Daudin R., Koebel P., Dorard E., Rose C., Hsieh F. J., Wu C. C., Potier B., Herault Y., Sala C., Corvin A., Allinquant B., Chang H. C., Treussart F., Simonneau M., Nat. Nanotechnol., 2017, 12(4), 322—328 |
[47] | Zhang D., Wei L., Zhong M., Xiao L., Li H. W., Wang J., Chem. Sci., 2018, 9(23), 5260—5269 |
[48] | Wu Y. Y., Ruan H. F., Zhao R., Dong Z. Z., Li W. H., Tang X. J., Yuan J. H., Fang X. H., Adv. Opt. Mater., 2018, 6(19), 1800333 |
[49] | Jin D. Y., Xi P., Wang B. M., Zhang L., Enderlein J., van Oijen A. M., Nat. Methods, 2018, 15(6), 415—423 |
[50] | Jaqaman K., Loerke D., Mettlen M., Kuwata H., Grinstein S., Schmid S. L., Danuser G., Nat. Methods, 2008, 5(8), 695—702 |
[51] | Meijering E., Dzyubachyk O., Smal I., Methods Enzymol., 2012, 504, 183—200 |
[52] | Chenouard N., Smal I., de Chaumont F., Maska M., Sbalzarini I. F., Gong Y., Cardinale J., Carthel C., Coraluppi S., Winter M., Cohen A. R., Godinez W. J., Rohr K., Kalaidzidis Y., Liang L., Duncan J., Shen H., Xu Y., Magnusson K. E. G., Jalden J., Blau H. M., Paul-Gilloteaux P., Roudot P., Kervrann C., Waharte F., Tinevez J. Y., Shorte S. L., Willemse J., Celler K., van Wezel G. P., Dan H. W., Tsai Y. S., Ortiz de Solorzano C., Olivo-Marin J. C., Meijering E., Nat. Methods, 2014, 11(3), 281—289 |
[53] | Calebiro D., Rieken F., Wagner J., Sungkaworn T., Zabel U., Borzi A., Cocucci E., Zuern A., Lohse M. J., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2013, 110(2), 743—748 |
[54] |
Ulbrich M. H., Isacoff E. Y., Nat. Methods, 2007, 4(4), 319—321
doi: 10.1038/nmeth1024 URL |
[55] |
Xu J. C., Qin G. G., Luo F., Wang L. N., Zhao R., Li N., Yuan J. H., Fang X. H., J. Am. Chem. Soc., 2019, 141(17), 6976—6985
doi: 10.1021/jacs.9b00688 URL |
[56] |
Yuan J. H., He K. M., Cheng M., Yu J. Q., Fang X. H., Chem. Asian J., 2014, 9(8), 2303—2308
doi: 10.1002/asia.v9.8 URL |
[57] |
Kusumi A., Sako Y., Yamamoto M., Biophys. J., 1993, 65(5), 2021—2040
doi: 10.1016/S0006-3495(93)81253-0 URL |
[58] | Andrec M., Levy R. M., Talaga D. S., J. Phys. Chem. A, 2003, 107(38), 7454—7464 |
[59] |
Persson F., Linden M., Unoson C., Elf J., Nat. Methods, 2013, 10(3), 265—269
doi: 10.1038/nmeth.2367 URL |
[60] |
Zhao R., Yuan J. H., Li N., Sun Y. H., Xia T., Fang X. H., Anal. Chem., 2019,91(21), 13390—13397
doi: 10.1021/acs.analchem.9b01005 URL |
[61] |
Zhao R., Li N., Xu J. C., Li W. H., Fang X. H., Acta Biochim. Biophys. Sin., 2018, 50(1), 51—59
doi: 10.1093/abbs/gmx121 URL |
[62] |
Mercer T. R., Neph S., Dinger M. E., Crawford J., Smith M. A., Shearwood A. M. J., Haugen E., Bracken C. P., Rackham O., Stamatoyannopoulos J. A., Filipovska A., Mattick J. S., Cell, 2011, 146(4), 645—658
doi: 10.1016/j.cell.2011.06.051 URL |
[63] |
Zhang W., Yuan J. H., Yang Y., Xu L., Wang Q., Zuo W., Fang X. H., Chen Y. G., Cell Res., 2010, 20(11), 1216—1223
doi: 10.1038/cr.2010.105 URL |
[64] |
Ma X. Y., Wang Q., Jiang Y. X., Xiao Z. Y., Fang X. H., Chen Y. G., Biochem. Biophys. Res. Commun., 2007, 356(1), 67—71
doi: 10.1016/j.bbrc.2007.02.080 URL |
[65] |
Lu Z. X., Murray J. T., Luo W. J., Li H. L., Wu X. P., Xu H. X., Backer J. M., Chen Y. G., J. Biol. Chem., 2002, 277(33), 29363—29368
doi: 10.1074/jbc.M203495200 URL |
[66] | Penheiter S. G., Mitchell H., Garamszegi N., Edens M., Dore J. J. E., Leof E. B., Mol. Cell Biol., 2002, 22(13), 4750—4759 |
[67] |
Li N., Yang Y., He K. M., Zhang F. Y., Zhao L. B., Zhou W., Yuan J. H., Liang W., Fang X. H., Sci. Rep., 2016, 6, 33469
doi: 10.1038/srep33469 URL |
[68] |
Conner S. D., Schmid S. L., Nature, 2003, 422(6927), 37—44
doi: 10.1038/nature01451 URL |
[69] | He K. M., Yan X. H., Li N., Dang S., Xu L., Zhao B., Li Z. J., Lv Z. Z., Fang X. H., Zhang Y. Y., Chen Y. G., Cell Res., 2015, 25(6), 738—752 |
[70] |
Zhang M. L., Zhang Z., He K., Wu J. M., Li N., Zhao R., Yuan J. H., Xiao H., Zhang Y. Y., Fang X. H., Anal. Chem., 2018, 90(7), 4282—4287
doi: 10.1021/acs.analchem.7b03448 URL |
[71] |
Chung I., Akita R., Vandlen R., Toomre D., Schlessinger J., Mellman I., Nature, 2010, 464(7289), 783—787
doi: 10.1038/nature08827 URL |
[72] |
Huang Y., Bharill S., Karandur D., Peterson S. M., Marita M., Shi X., Kaliszewski M. J., Smith A. W., Isacoff E. Y., Kuriyan J., eLife, 2016, 5, e14107
doi: 10.7554/eLife.14107 URL |
[73] |
Xiao Z. Y., Ma X. Y., Jiang Y. X., Zhao Z. L., Lai B., Liao J. Y., Yue J. C., Fang X. H., J. Phys. Chem. B, 2008, 112(13), 4140—4145
doi: 10.1021/jp710302j URL |
[74] | Song D. K., Meng J. C., Cheng J., Fan Z., Chen P. Y., Ruan H. F., Tu Z. Y., Kang N., Li N., Xu Y., Wang X. B., Shi F., Mu L. B., Li T. F., Ren W. R., Lin X., Zhu J., Fang X., Amrein M. W., Wu W. H., Yan L. T., Lu J. H., Xia T., Shi Y., Nature Microbiology, 2019, 4(1), 97—111 |
[75] | Felce J. H., Davis S. J., Klenerman D., Trends Pharmacol. Sci., 2018, 39(2), 96—108 |
[76] | Black J. B., Premont R. T., Daaka Y., Semin. Cell Dev. Biol., 2016, 50, 95—104 |
[77] | Sungkaworn T., Jobin M. L., Burnecki K., Weron A., Lohse M. J., Calebiro D., Nature, 2017, 550(7677), 543—547 |
[78] |
Chaplin R., Thach L., Hollenberg M. D., Cao Y., Little P. J., Kamato D., J. Cell Commun. Signal, 2017, 11(2), 117—125
doi: 10.1007/s12079-017-0375-9 URL |
[79] |
Sun Y. H., Li N., Zhang M. L., Zhou W., Yuan J. H., Zhao R., Wu J. M., Li Z. J., Zhang Y. Y., Fang X. H., Chem. Commun., 2016, 52(44), 7086—7089
doi: 10.1039/C6CC00628K URL |
[80] | Zhang M. L., He K. M., Wu J. M., Li N., Yuan J. H., Zhou W., Ye Z., Li Z. J., Xiao H., Lv Z. Z., Zhang Y. Y., Fang X. H., Sci. China-Chem., 2017, 60(10), 1310—1317 |
[81] |
Santos R., Ursu O., Gaulton A., Bento A. P., Donadi R. S., Bologa C. G., Karlsson A., Al-Lazikani B., Hersey A., Oprea T. I., Overington J. P., Nat. Rev. Drug Discov., 2017, 16(1), 19—34
doi: 10.1038/nrd.2016.230 URL |
[82] | Yanagawa M., Hiroshima M., Togashi Y., Abe M., Yamashita T., Shichida Y., Murata M., Ueda M., Sako Y., Sci. Signal., 2018, 11(548), eaao1917 |
[83] | He K. M., Fu Y. N., Zhang W., Yuan J. H., Li Z. J., Lv Z. Z., Zhang Y. Y., Fang X. H., Biochem. Biophys. Res. Commun., 2011, 407(2), 313—317 |
[84] | Yang Y., Xu Y. C., Xia T., Chen F. J., Zhang C. L., Liang W., Lai L. H., Fang X. H., Chem. Commun., 2011, 47(19), 5440—5442 |
[85] | Xiao H., Zhang J. S., Xu Z. H., Feng Y. N., Zhang M. L., Liu J. L., Chen R. F., Shen J., Wu J. M., Lu Z. Z., Fang X. H., Li J. Y., Zhang Y. Y., Sci. Rep., 2016, 6, 28597 |
[86] | Wisler J. W., DeWire S. M., Whalen E. J., Violin J. D., Drake M. T., Ahn S., Shenoy S. K., Lefkowitz R. J., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2007, 104(42), 16657—16662 |
[1] | WU Xueyuan, YING Yilun, LONG Yitao. Construction and High Selectivity of Aerolysin Single Molecular Interface for Single Molecule Analysis † [J]. Chem. J. Chinese Universities, 2019, 40(9): 1825. |
Viewed | ||||||
Full text |
|
|||||
Abstract |
|
|||||