高等学校化学学报 ›› 2005, Vol. 26 ›› Issue (3): 485.
王长生, 王嘉, 杨忠志
收稿日期:
2004-06-08
出版日期:
2005-03-10
发布日期:
2005-03-10
通讯作者:
王长生(1963年出生),男,博士,教授,博士生导师,从事理论和计算化学研究.E-mail:chwangcs2003@yahoo.com.cn
E-mail:chwangcs2003@yahoo.com.cn
基金资助:
国家自然科学基金(批准号:20173025);辽宁省教育厅基金(批准号:2004C019)资助.
Wang Chang-Sheng, Wang Jia, Yang Zhong-Zhi
Received:
2004-06-08
Online:
2005-03-10
Published:
2005-03-10
摘要: 使用B3LYP/6-31G*方法优化得到了丙氨酸二肽和三肽分子的23个稳定构象.定义了丙氨酸多肽中的特殊氢原子.对构象中与特殊氢原子有关的主要弱相互作用进行了分析,提出了一种快速确定多肽构象稳定性的新方法.确定了相应的弱相互作用参数.将新方法应用于三肽分子构象相对稳定性的预测,得到了满意的结果.
中图分类号:
TrendMD:
王长生, 王嘉, 杨忠志. 快速确定丙氨酸-α-多肽构象稳定性的新方法. 高等学校化学学报, 2005, 26(3): 485.
Wang Chang-Sheng, Wang Jia, Yang Zhong-Zhi . A New Method for Quick Determining Conformation Stability of Alanine-α-polypeptide. Chem. J. Chinese Universities, 2005, 26(3): 485.
[1] Dobson C.M.,Sali A.,Karplus M..Angew.Chem.Int.Ed.[J],1998,37:868_893 [2] Garcia-Viloca M.,Gao J.,Karplus M.et al..Science[J],2004,303:186_195 [3] Wu Y.D.,Wang D.P..J.Am.Chem.Soc.[J],1999,121:9352_9362 [4] Zhao Y.L.,Wu Y.D..J.Am.Chem.Soc.[J],2001,123:5313_5319 [5] Wang Chang-Sheng(王长生),Qi Xue-Jie(齐学洁),Ma Ying-Ge(马英格)et al..Chem.J.Chinese Universities(高等学校化学学报)[J],2004,25(6):1111_1114 [6] Vargas R.,Garza J.,Dixon D.A.et al..J.Am.Chem.Soc.[J],2000,122:4750—4755 [7] Lee H.-J.,Kim J.H.,Jung H.J.et al..J.Comput.Chem.[J],2003,25:169_178 [8] Hohenberg P.,Kohn W..Phys.Rev.B[J],1964,136:864_871 [9] Lantz M.A.,Jarvis S.P.,Tokumoto H.et al..Chem.Phys.Lett ers[J],1999,315:61_68 |
[1] | 温夏夏, 南士滨, 黄迎, 任天瑞, 姚建华. 氨基酸突变对GABAa受体结合能力的影响[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(12): 2708. |
[2] | 李作盛, 邹陆一, 任爱民, 封继康. 萤火虫氧化荧光素类似物电子光谱的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(12): 2757. |
[3] | 饶欢, 杨文泓, 王思邈, 孔滨, 刘文志, 李晓霞, 杨小震. 水在纳米管道中流动行为的分子动力学模拟[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(12): 2727. |
[4] | 高婷, 韩博, 李辉, 李鸿志, 吕英华, 苏忠民. 最小二乘支持向量机方法用于提高低水平量子化学方法计算吸收能的精度[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(12): 2734. |
[5] | 高斯萌, 贺海鹏, 丁益宏. Sn和Pb单掺杂Al4小团簇的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(12): 2739. |
[6] | 孟素慈, 殷秀莲, 马晶, 谢吉民. 有机π共轭配体溶剂化效应与分子间相互作用的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(11): 2492. |
[7] | 苏满秀, 王立峰, 代志军, 袁哲明, 柏连阳. 多肽一级结构表征与抗菌肽QSAM建模[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(11): 2526. |
[8] | 仇毅翔, 王曙光. 膦配体对金团簇[Au@Au8(PR3)8]3+(R=Me,OMe,H,F,Cl,CN)稳定化作用的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(11): 2549. |
[9] | 潘显超, 梅虎, 谢江安, 吕娟, 王青, 张亚兰, 谭文. 基于VHSE结构表征的TAP亲和活性预测及选择特异性分析[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(11): 2556. |
[10] | 樊丽涛, 李莹, 吴迪, 李志儒, 孙家锺. 碱金属化物M+@H6Aza222M'-·2MeNH2(M,M'=Li,Na,K)一阶超极化率的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(10): 2320. |
[11] | 刘楠楠, 丁益宏. 开环茂金属成环及氢分子消除反应机理的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(10): 2303. |
[12] | 刘英哲, 蔡文生, 邵学广. 疏水蛋白吸附碳纳米管的分子动力学模拟[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(09): 2013. |
[13] | 刘楠楠, 丁益宏. 硼取代后氨化处理的分子筛碱性的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(09): 2043. |
[14] | 李鹏, 张恒军, 朱东霞, 单国刚, 廖奕, 苏忠民. 酚基嘧啶铍(Ⅱ)配合物的合成及光电性质[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(09): 2056. |
[15] | 程凡升, 张茂秋, 程凡杰, 生吉萍, 陈婧雨, 郑鄢燕, 申琳. 结构预测及分子对接方法研究几种水解产物对新阿魏酸酯酶的抑制作用[J]. 高等学校化学学报, 2012, 33(08): 1788. |
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