摘要: 提出了把简化的接触表面静电互补模型与溶剂化能模型相结合的新的Docking计算方法.编写了计算模拟程序ESCOLD,并用于酶-短肽体系的Docking计算.对3个已知X射线晶体结构的酶-抑制剂肽链复合物中的六肽用ESCOLD重新进行了Docking计算.用溶剂化能作为评价函数,正确地预测出接近实验结果的六肽取向.
中图分类号:
TrendMD:
李菲, 王玉宏, 李惟, 周慧, 毛友钢, 沈家骢. 建立短肽抑制剂与酶识别的模式──基于表面静电互补和溶剂化能的Docking计算方法. 高等学校化学学报, 2000, 21(11): 1703.
LI Fei, WANG Yu-Hong, LI Wei, ZHOU Hui, MAO You-Gang, SHEN Jia-Cong . Modeling Enzyme-phage Peptide Recognition——Docking Method Based on Surface Electrostatic Complementary and Solvation Energy. Chem. J. Chinese Universities, 2000, 21(11): 1703.