空间距离在三维分子相似度计算中的应用

高等学校化学学报 ›› 1999, Vol. 20 ›› Issue (11): 1692.

空间距离在三维分子相似度计算中的应用

杨嘉安, 许禄

中国科学院长春应用化学研究所, 长春 130022

收稿日期:1998-11-18 出版日期:1999-11-24 发布日期:1999-11-24
通讯作者: 许禄
作者简介:杨嘉安,男,28岁,博士研究生.
基金资助:
国家自然科学基金(批准号:29677016)资助课题

Atom Space Distance and Computing of Molecular Similarity

YANG Jia-An, XU Lu

Changchun Institute of Applied Chemistry, Academia Sinica, Changchun 130022, China

Received:1998-11-18 Online:1999-11-24 Published:1999-11-24

摘要/Abstract

摘要： 采用Tripos公司的MOPAC模块计算分子的空间距离,所得距离矩阵用带有约束条件的空间距离方法计算分子的相似度,同时通过4组化合物的计算,与纯空间距离方法进行比较,得到了较为满意的结果。

关键词: 有约束的空间距离, 分子相似度, 先导化合物的筛选

Abstract: Amathematical model on computation of molecular similarity was suggested. The algorithmic techniques for measuring the degree of similarity between pairs of three-dimensional chemical molecules was represented by modified interatomic distance matrices. Current work was carried out on Indigo 2 work station with Sybyl software. Four groups of molecules were used to compute the molecules similarity to testing the mathematical model with satisfatory results.

Key words: Modified stereo-distance, Molecular similarity, Leading compounds

中图分类号:

O657

TrendMD:

杨嘉安, 许禄. 空间距离在三维分子相似度计算中的应用. 高等学校化学学报, 1999, 20(11): 1692.

YANG Jia-An, XU Lu . Atom Space Distance and Computing of Molecular Similarity. Chem. J. Chinese Universities, 1999, 20(11): 1692.

[1]	张庆友,许禄 . 原子对空间距离法及其应用[J]. 高等学校化学学报, 2008, 29(7): 1438.
[2]	张庆友, 许禄, 章文军. 广义二面角在定量结构/活性相关分析中的应用[J]. 高等学校化学学报, 2002, 23(6): 1053.