Chem. J. Chinese Universities ›› 2023, Vol. 44 ›› Issue (3): 20220346.doi: 10.7503/cjcu20220346
• Review • Previous Articles Next Articles
KONG Hao, XU Feiyang, WANG Yixiang, ZHANG Yan()
Received:
2022-05-16
Online:
2023-03-10
Published:
2023-03-14
Contact:
ZHANG Yan
E-mail:njuzy@nju.edu.cn
Supported by:
CLC Number:
TrendMD:
KONG Hao, XU Feiyang, WANG Yixiang, ZHANG Yan. Research Progress of CRISPR-Cas9 Functional Regulation System Based on Small Molecule Reaction Tools[J]. Chem. J. Chinese Universities, 2023, 44(3): 20220346.
1 | Doudna J. A., Charpentier E., Science, 2014, 346, 1258096 |
2 | Knott G. J., Doudna J. A., Science, 2018, 361, 866—869 |
3 | Capecchi M. R., Science, 1989, 244, 1288—1292 |
4 | Rudin N., Sugarman E., Haber J. E., Genetics, 1989, 122, 519—534 |
5 | Rouet P., Smih F., Jasin M., Mol. Cell. Biol., 1994, 14, 8096—8106 |
6 | Klug A., Rhodes D., Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 1987, 52, 473—482 |
7 | Kim Y. G., Cha J., Chandrasegaran S., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1996, 93, 1156—1160 |
8 | Boch J., Scholze H., Schornack S., Landgraf A., Hahn S., Kay S., Lahaye T., Nickstadt A., Bonas U., Science, 2009, 326, 1509—1512 |
9 | Moscou M. J., Bogdanove A. J., Science, 2009, 326, 1501 |
10 | Makarova K. S., Wolf Y. I., Iranzo J., Shmakov S. A., Alkhnbashi O. S., Brouns S. J. J., Charpentier E., Cheng D., Haft D. H., Horvath P., Moineau S., Mojica F. J. M., Scott D., Shah S. A., Siksnys V., Terns M. P., Venclovas C., White M. F., Yakunin A. F., Yan W., Zhang F., Garrett R. A., Backofen R., van der Oost J., Barrangou R., Koonin E. V., Nat. Rev. Microbiol., 2020, 18, 67—83 |
11 | Doudna J. A., Charpentier E., Science, 2014, 346, 1258096 |
12 | Hsu P. D., Lander E. S., Zhang F., Cell, 2014, 157, 1262—1278 |
13 | Stadtmauer E. A., Fraietta J. A., Davis M. M., Cohen A. D., Weber K. L., Lancaster E., Mangan P. A., Kulikovskaya I., Gupta M., Chen F., Tian L. F., Gonzalez V. E., Xu J., Jung I. Y., Melenhorst J. J., Plesa G., Shea J., Matlawski T., Cervini A., Gaymon A. L., Desjardins S., Lamontagne A., Salas-Mckee J., Fesnak A., Siegel D. L., Levine B. L., Jadlowsky J. K., Young R. M., Chew A., Hwang W. T., Hexner E. O., Carreno B. M., Nobles C. L., Bushman F. D., Parker K. R., Qi Y. Y., Satpathy A. T., Chang H.Y., Zhao Y. B., Lacey S. F., June C. H., Science, 2020, 367, eaba7365 |
14 | Zhang M., Eshraghian E. A., Al Jammal O., Zhang Z. B., Zhu X., Biomed. Pharmacother., 2021, 133, 111007 |
15 | Zhang D., Zhang D. Q., Zhang Z. Y., Unver T., Zhang B. H., J. Adv. Res., 2021, 29, 207—211 |
16 | Zhu H. C., Li C., Gao C. X., Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 2020, 21, 661—677 |
17 | Musunuru K., Chadwick A. C., Mizoguchi T., Garcia S. P., DeNizio J. E., Reiss C. W., Wang K., Iyer S., Dutta C., Clendaniel V., Amaonye M., Beach A., Berth K., Biswas S., Braun M. C., Chen H. M., Colace T. V., Ganey J. D., Gangopadhyay S. A., Garrity R., Kasiewicz L. N., Lavoie J., Madsen J. A., Matsumoto Y., Mazzola A. M., Nasrullah Y. S., Nneji J., Ren H., Sanjeev A., Shay M., Stahley M. R., Fan S. H. Y., Tam Y. K., Gaudelli N. M., Ciaramella G., Stolz L. E., Malyala P., Cheng C. J., Rajeev K. G., Rohde E., Bellinger A. M., Kathiresan S., Nature, 2021, 593, 429—434 |
18 | Dawson T. M., Golde T. E., Lagier⁃Tourenne C., Nat. Neurosci., 2018, 21, 1370—1379 |
19 | Maresch R., Mueller S., Veltkamp C., Oellinger R., Friedrich M., Heid I., Steiger K., Weber J., Engleitner T., Barenboim M., Klein S., Louzada S., Banerjee R., Strong A., Stauber T., Gross N., Geumann U., Lange S., Ringelhan M., Varela I., Unger K., Yang F. T., Schmid R. M., Vassiliou G. S., Braren R., Schneider N., Heikenwalder M., Bradley A., Saur D., Rad R., Nat. Commun., 2016, 7, 10770 |
20 | Kaneko T., Tanaka S., Biochem. Bioph. Res. Co., 2020, 527, 1039—1042 |
21 | Yan Q., Zhang Q., Yang H., Zou Q., Tang C., Fan N., Lai L., Cell Regen., 2014, 3, 11 |
22 | Vilarinor M., Rashid S. T., Suchy F. P., McNabb B., van der Meulen T., Fine E. J., Ahsan S. D., Mursaliyev N., Sebastiano V., Diab S. S., Huising M. O., Nakauchi H., Ross P. J., Sci. Rep., 2020, 10, 7500 |
23 | Fujii W., Kawasaki K., Sugiura K., Naito K., Nucleic Acids Res., 2013, 41, e187 |
24 | Ryu J. Y., Won E. J., Lee H. A. R., Kim J. H., Hui E., Kim H. P., Yoon T. J., Biomaterials, 2020, 232, 119736 |
25 | Zhang S., Shen J., Li D., Cheng Y., Theranostics, 2021, 11, 614—648 |
26 | Xu C. F., Chen G. J., Luo Y. L., Zhang Y., Zhao G., Lu Z. D., Czarna A., Gu Z., Wang J., Adv. Drug. Deliv. Rev., 2021, 168, 3—29 |
27 | Chuang Y. F., Phipps A. J., Lin F. L., Hecht V., Hewitt A. W., Wang P. Y., Liu G. S., Cell. Mol. Life Sci., 2021, 78, 2683—2708 |
28 | Pattanayak V., Lin S., Guilinger J. P., Ma E., Doudna J. A., Liu D. R., Nat. Biotechnol., 2013, 31, 839—843 |
29 | Zischewski J., Fischer R., Bortesi L., Biotechnol. Adv., 2017, 35, 95—104 |
30 | Wang Y., Cheng X., Shan Q. W., Zhang Y., Liu J. X., Gao C. X., Qiu J. L., Nat. Biotechnol., 2014, 32, 947—951 |
31 | Fu Y. F., Sander J. D., Reyon D., Cascio V. M., Joung J. K., Nat. Biotechnol., 2014, 32, 279—284 |
32 | Cromwell C. R., Sung K., Park J., Krysler A. R., Jovel J., Kim S. K., Hubbard B. P., Nat. Commun., 2018, 9, 1448 |
33 | Brown W., Zhou W., Deiters A., ChemBioChem, 2021, 22, 63—72 |
34 | Gangopadhyay S. A., Cox K. J., Manna D., Lim D., Maji B., Zhou Q., Choudhary A., Biochemistry, 2019, 58, 234—244 |
35 | Tang W., Hu J. H., Liu D. R., Nat. Commun., 2017, 8, 15939 |
36 | Lin J., Wang W. J., Wang Y., Liu Y., Xu L., J. Am. Chem. Soc., 2021, 143, 19834—19843 |
37 | Kundert K., Lucas J. E., Watters K. E., Fellmann C., Ng A. H., Heineike B. M., Fitzsimmons C. M., Oakes B. L., Qu J., Prasad N., Rosenberg O. S., Savage D. F., El⁃Samad H., Doudna J. A., Kortemme T., Nat. Commun., 2019, 10, 2127 |
38 | Jain S., Xun G. Abesteh S., Ho S., Lingamaneni M., Martin T. A., Tasan I., Yang C., Zhao H., ACS Synth. Biol., 2021, 10, 1320—1327 |
39 | Manna D., Maji B., Gangopadhyay S. A., Cox K. J., Zhou Q., Law B. K., Mazitschek R., Choudhary A., Angew. Chem. Int. Ed., 2019, 58, 6285—6289 |
40 | Nihongaki Y., Kawano F., Nakajima T., Sato M., Nat. Biotechnol., 2015, 33, 755—760 |
41 | Taiariol L., Chaix C., Farre C., Moreau E., Chem. Rev., 2022, 122, 340—384 |
42 | Wang J., Wang X., Fan X., Chen P. R., ACS Cent. Sci., 2021, 7, 929—943 |
43 | Scinto S. L., Bilodeau D. A., Hincapie R., Lee W., Nguyen S. S., Xu M., Am Ende C. W., Finn M. G., Lang K., Lin Q., Pezacki J. P., Prescher J. A., Robillard M. S., Fox J. M., Nat. Rev. Methods Primers, 2021, 1, 30—84 |
44 | Kumar G. S., Lin Q., Chem. Rev., 2021, 121, 6991—7031 |
45 | He K., Chou E. T., Begay S., Anderson E. M., van Brabant Smith A., ChemBioChem, 2016, 17, 1809—1812 |
46 | Taemaitree L., Shivalingam A., El-Sagheer A. H., Brown T., Nat. Commun., 2019, 10, 1610—1617 |
47 | Hüll K., Morstein J., Trauner D., Chem. Rev., 2018, 118, 10710—10747 |
48 | Li J., Kong, H., Zhu C., Zhang Y., Chem. Sci., 2020, 11, 3390—3396 |
49 | Jain P. K., Ramanan V., Schepers A. G., Dalvie N. S., Panda A., Fleming H. E., Bhatia S. N., Angew. Chem. Int. Ed., 2016, 55, 12440—12444 |
50 | Zhou W., Brown W., Bardhan A., Delaney M., Ilk A. S., Rauen R. R., Kahn S. I., Tsang M., Deiters A., Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 8998—9003 |
51 | Moroz⁃Omori E. V., Satyapertiwi D., Ramel M. C., Hogset H., Sunyovszki I. K., Liu Z., Wojciechowski J. P., Zhang Y., Grigsby C. L., Brito L., Bugeon L., Dallman M. J., Stevens M. M., ACS Cent. Sci., 2020, 6, 695—703 |
52 | Liu Y., Zou R.S., He S., Nihongaki Y., Li X., Razavi S., Wu B., Ha T., Science, 2020, 368, 1265—1269 |
53 | Wang Y., Liu Y., Xie F., Lin J., Xu L., Chem. Sci., 2020, 11, 11478—11484 |
54 | Zhang Y., Ling X., Su X., Zhang S., Wang J., Zhang P., Feng W., Zhu Y. Y., Liu T., Tang X., Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 20895—20899 |
55 | Wang S., Wei L., Wang J. Q., Ji H., Xiong W., Liu J., Yin P., Tian T., Zhou X., ACS Chem. Biol., 2020, 15, 1455—1463 |
56 | Zhang D., Liu L., Jin S., Tota E., Li Z., Piao X., Zhang X., Fu X. D., Devaraj N. K., J. Am. Chem. Soc., 2022, 144, 4487—4495 |
57 | Carlson⁃Stevermer J., Kelso R., Kadina A., Joshi S., Rossi N., Walker J., Stoner R., Maures T., Nat. Commun., 2020, 11, 5041—5047 |
58 | Habibian M., McKinlay C., Blake T. R., Kietrys A. M., Waymouth R. M., Wender P. A., Kool E. T., Chem. Sci., 2019, 11, 1011—1016 |
59 | Wang S. R., Wu L. Y., Huang H. Y., Xiong W., Liu J., Wei L., Yin P., Tian T., Zhou X., Nat. Commun., 2020, 11, 91—101 |
60 | Xiong W., Liu X., Qi Q., Ji H., Liu F., Zhong C., Liu S., Tian T., Zhou X., Nucleic Acids Res., 2022, 50, 1241—1255 |
61 | Gu C., Xiao L., Shang J., Xu X., He L., Xiang Y., Chem. Sci., 2021, 12, 9934—9945 |
62 | Hemphill J., Borchardt E. K., Brown K., Asokan A., Deiters A., J. Am. Chem. Soc., 2015, 137, 5642—5645 |
63 | Pan Y. C., Yang J. J., Luan X. W., Liu X. L., Li X. Q., Yang J., Huang T., Sun L., Wang Y. Z., Lin Y. H., Song Y. J., Sci. Adv., 2019, 5, eaav7199 |
64 | Lyu Y., He S., Li J., Jiang Y., Sun H., Miao Y., Pu K., Angew. Chem. Int. Ed., 2019, 58, 18197—18201 |
65 | Li X., Pan Y., Chen C., Gao Y., Liu X., Yang K., Luan X., Zhou D., Zeng F., Han X., Song Y., Angew. Chem. Int. Ed., 2021, 60, 21200—21204 |
66 | Kwiatkowski S., Knap B., Przystupski D., Saczko J., Kedzierska E., Knap⁃Czop K., Kotlinska J., Michel O., Kotowski K., Kulbacka J., Biomed. Pharmacother., 2018, 106, 1098—1107 |
67 | Li X., Kwon N., Guo T., Liu Z., Yoon J., Angew. Chem. Int. Ed., 2018, 57, 11522—11531 |
68 | Mfouo⁃Tynga I. S., Dias L. D., Inada N. M., Kurachi C., Photodiagnosis Photodyn. Ther., 2021, 34, 102091 |
69 | He M., Li J., Han H., Borges C. A., Neiman G., Roise J. J., Hadaczek P., Mendonsa R., Holm V. R., Wilson R. C., Bankiewicz K., Zhang Y., Sadlowski C. M., Healy K., Riley L. W., Murthy N., Chem. Sci., 2020, 11, 8973—8980 |
70 | Ling X., Xie B., Gao X., Chang L., Zheng W., Chen H., Huang Y., Tan L., Li M., Liu T., Sci. Adv., 2020, 6, eaaz0051 |
71 | Ling X., Chang L., Chen H., Gao X., Yin J., Zuo Y., Huang Y., Zhang B., Hu J., Liu T., Mol. Cell, 2021, 81, 1—10 |
[1] | CHANG Liying, LING Xinyu, CHEN Heqi, WANG Xue, LIU Tao. Applications of Gene Editing in Mitochondrial Diseases [J]. Chem. J. Chinese Universities, 2023, 44(3): 20220363. |
Viewed | ||||||
Full text |
|
|||||
Abstract |
|
|||||