拟南芥乙酰羟基酸合成酶与磺酰脲的相互作用以及CoMFA研究

高等学校化学学报

拟南芥乙酰羟基酸合成酶与磺酰脲的相互作用以及CoMFA研究

班树荣, 牛聪伟, 陈文彬, 任晓白, 余志红, 席真

南开大学元素有机化学国家重点实验室, 化学生物学系, 天津 300071

收稿日期:2006-03-22 修回日期:1900-01-01 出版日期:2007-03-10 发布日期:2007-03-10
通讯作者: 席真

Interaction and CoMFA Studies on A. thaliana Acetohydroxyacid Synthase by Sulfonylureas

BAN Shu-Rong, NIU Cong-Wei, CHEN Wen-Bin, REN Xiao-Bai, YU Zhi-Hong, XI Zhen

State Key Laboratory of Elemento-Organic Chemistry, Department of Chemical Biology, Nankai University, Tianjin 300071, China

Received:2006-03-22 Revised:1900-01-01 Online:2007-03-10 Published:2007-03-10
Contact: XI Zhen

摘要/Abstract

摘要： 在分子水平上较为详尽地研究了85个磺酰脲类化合物与植物源野生型拟南芥AHAS酶的离体相互作用, 测定了这些化合物对AHAS酶的抑制常数K_i^app. 采用比较分子力场方法(CoMFA)对这些化合物与AHAS酶的相互作用进行了三维构效关系研究, 用此模型预测了检验组10个化合物的pK_i^app值, 模型的预测结果与测试结果一致.

关键词: 乙酰羟基酸合成酶, 拟南芥, 磺酰脲, 比较分子力场分析(CoMFA)

Abstract: Acetohydroxyacid synthase(AHAS) is the target for sulfonylurea, imidazolinone, triazolopymiding sulfonaniline and pyrimidin-2-yl salicylate herbicides. The interactions between wild type A. thaliana Acetohydroxyacid synthase(AHAS) and 85 synthesized sulfonylureas in vitro were studied, obtained K_i^app values of all compounds by the method of Westerfeld and Singh. The structure-activity relationship and 3D-QSAR was investigated by using comparative molecular fields analysis(CoMFA). The cross-validated q² and the relation coefficient r² for the model established by the study are 0.811 and 0.934 respectively, with a F value of 246.506 and a standard deviation(s) of 0.419. The obtained satisfied QSAR model was is consistent with those based on in vivo data and showed a high ability to predict the biological activity(-lgK_i^app) for ten test set compounds. These results will be useful for design and synthesis of highly active compounds.

Key words: Acetohydroxyacid synthase, A. thaliana, Sulfonylureas, CoMFA

中图分类号:

TrendMD:

班树荣, 牛聪伟, 陈文彬, 任晓白, 余志红, 席真 . 拟南芥乙酰羟基酸合成酶与磺酰脲的相互作用以及CoMFA研究. 高等学校化学学报, doi: .

BAN Shu-Rong, NIU Cong-Wei, CHEN Wen-Bin, REN Xiao-Bai, YU Zhi-Hong, XI Zhen. Interaction and CoMFA Studies on A. thaliana Acetohydroxyacid Synthase by Sulfonylureas. Chem. J. Chinese Universities, doi: .

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