固氮酶活性中心结构模型的EHMO研究

高等学校化学学报 ›› 1993, Vol. 14 ›› Issue (7): 996.

固氮酶活性中心结构模型的EHMO研究

刘爱民, 周泰锦, 万惠霖, 蔡启瑞

厦门大学化学系, 厦门 361005

收稿日期:1993-04-05 修回日期:1993-06-03 出版日期:1993-07-24 发布日期:1993-07-24
通讯作者: 刘爱民.
作者简介:第一作者:男, 29岁, 博士, 博士后.
基金资助:
国家基础性研究重大关键项目(攀登计划);国家教育委员会博士后基金

Structural Information of Nitrogenase Active-Center Clusters Deduced from EHMO Study

LIU Ai-Min, ZHOU Tai-Jin, WAN Hui-Lin, TSAI Khi-Rui

Department of Chemistry, Xiamen University, Xiamen, 361005

Received:1993-04-05 Revised:1993-06-03 Online:1993-07-24 Published:1993-07-24

摘要/Abstract

摘要： 应用群分解EHMO程序,研究了基于MoFe-蛋白X射线衍射结果的固氮酶活性中心结构模型.对比和分析了该模型中尚未确定的配体Y分别为S、O、N、C、H和H…H时的总能量和电荷分布等.结果表明Y=O量为有利.本文进一步提出了Y=O的模型在底物活化过程中Y(O)的邻位加氢后作为活性中心吞吐底物与产物窗口的可能作用方式.

关键词: 固氮酶, 活性中心, 模型化合物, EHMO量子化学方法

Abstract: Structural models for the nitrogenase FeMo-cofactor based upon the crystallographic analysis of the nitrogenase MoFe-protein were studied by means of the improved method of EHMOcalculations, where the interest was focused on the unknown ligand Yof the Ree's model.The results gained from cases of Y=S, N,O, C, Hand H…Hsuggested that the ligand Ywas very like O (model I0 and model X).Aprobable hydrogenation mechanism (model L) was eventually proposed and discussed in the present paper.

Key words: Nitrogenase, Activity center, Model compounds, EHMO Quantum chemistry approach

TrendMD:

刘爱民, 周泰锦, 万惠霖, 蔡启瑞. 固氮酶活性中心结构模型的EHMO研究. 高等学校化学学报, 1993, 14(7): 996.

LIU Ai-Min, ZHOU Tai-Jin, WAN Hui-Lin, TSAI Khi-Rui. Structural Information of Nitrogenase Active-Center Clusters Deduced from EHMO Study. Chem. J. Chinese Universities, 1993, 14(7): 996.

[1]	周雷雷, 程海洋, 赵凤玉. Pd基多相催化剂上CO₂加氢反应的研究进展[J]. 高等学校化学学报, 2022, 43(7): 20220279.
[2]	刘丽丽, 台夕市, 刘均波, 李丹, 周小晶, 张丽君, 危潇飞. 双活性中心催化剂的制备及催化合成炔丙基胺[J]. 高等学校化学学报, 2018, 39(3): 482.
[3]	汤海燕, 赵茂爽, 冯莉, 曹泽星. 褐煤模型化合物中含氧官能团脱出反应的理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2014, 35(11): 2370.
[4]	黄玉成, 王素凡, 居学海, 杜金艳, 周涛, 叶世勇. 哒嗪裂解反应机理的密度泛函理论研究[J]. 高等学校化学学报, 2009, 30(5): 1005.
[5]	曹剑, 丁红, 那辉, 李先锋, 张春玲, 吴忠文. 不同端基联苯型聚醚醚酮(PEDEK)齐聚物的合成[J]. 高等学校化学学报, 2003, 24(8): 1503.
[6]	高雪峰, 赵熹, 黄旭日, 孙家锺. SARS病毒蛋白水解酶的三维结构模建及可能的小肽抑制剂研究[J]. 高等学校化学学报, 2003, 24(12): 2279.
[7]	颜文斌, 周朝晖, 章慧, 万惠霖, 蔡启瑞. 苹果酸钼外消旋体的合成、光谱性质和结构表征[J]. 高等学校化学学报, 2001, 22(12): 1967.
[8]	刘晓华, 亢茂青, 王心葵. 锌/钴双金属氰化物络合物催化剂(DMC)催化环氧丙烷聚合反应的活性结构研究[J]. 高等学校化学学报, 2000, 21(11): 1748.
[9]	李冬梅, 李亚丰, 邢永恒, 王仁章, 刘淑清, 孙浩然, 王铁钢, 徐吉庆, 邢燕, 林永华, 贾恒庆. 含柠檬酸配体的钼硫簇合物的合成与晶体结构的测定[J]. 高等学校化学学报, 2000, 21(10): 1464.
[10]	周朝晖, 缪建英, 万惠霖. 含质子柠檬酸氧钒(V)配合物中间体的合成和晶体结构[J]. 高等学校化学学报, 1997, 18(1): 11.
[11]	曹宪一, 王强, 武冠英. 控制异丁烯阳离子聚合终止方式的新方法──活性中心转化法[J]. 高等学校化学学报, 1995, 16(9): 1485.
[12]	柯扬船, 吴忠文, 郑玉斌, 孙家锺. 聚醚醚酮链结构与反应的模型化合物的量子化学研究[J]. 高等学校化学学报, 1995, 16(9): 1426.
[13]	黄静伟, 张风章, 许良树, 张鸿图, 万惠霖, 蔡启瑞. 固氮酶及合成氨Fe催化剂中N₂的络合位[J]. 高等学校化学学报, 1995, 16(6): 920.
[14]	蔡炳新, 郑小明. Li⁺/MgO上乙烷氧化脱氢制乙烯的研究(Ⅱ)──催化作用机理[J]. 高等学校化学学报, 1995, 16(6): 929.
[15]	黄静伟, 张鸿图, 杨如, 周明玉, 万惠霖, 蔡启瑞. 模拟固氮酶中Mo微环境的化学探测[J]. 高等学校化学学报, 1995, 16(4): 632.