| 1 |
Ren P.， Chun J.， Thomas D. G.， Schnieders M. J.， Marucho M.， Zhang J.， Baker N. A.， Q. Rev. Biophys.， 2012， 45（4）， 427—491
|
| 2 |
Liu C.， Qi R.， Wang Q.， Piquemal J. P.， Ren P.， J. Chem. Theory Comput.， 2017， 13（6）， 2751—2761
|
| 3 |
Oshima H.， Kinoshita M.， J. Chem. Phys.， 2015， 142（14）， 145103
|
| 4 |
Guo H.， Gresh N.， Roques B. P.， Salahub D. R.， J. Phys. Chem. B， 2000， 104（41）， 9746—9754
|
| 5 |
Wu X. H.， Zhang H.， Wu Y. D.， Proteins： Struct.， Funct.， Bioinf.， 2010， 78（5）， 1186—1194
|
| 6 |
Ejtehadi M. R.， Ejtehadi S. P.， Plotkin S. S.， Proc. Natl. Acad. Sci. USA， 2004， 101（42）， 15088—15093
|
| 7 |
Ghosh A.， Hochstrasser R. M.， Chem. Phys.， 2011， 390（1）， 1—13
|
| 8 |
Li S.， Tan P.， Li J.， Tang M.， Hong L.， Phys. Rev. Res.， 2022， 4（2）， L022003
|
| 9 |
Yamasaki K.， Tsuzuki S.， Tateno H.， J. Phys. Chem. B， 2024， 128（30）， 7401—7406
|
| 10 |
Cisneros G. A.， Wikfeldt K. T.， Ojamäe L.， Lu J.， Xu Y.， Torabifard H.， Bartók A. P.， Csányi G.， Molinero V.， Paesani F.， Chem. Rev.， 2016， 116（13）， 7501—7528
|
| 11 |
Kaminski G. A.， Stern H. A.， Berne B. J.， Friesner R. A.， Cao Y. X.， Murphy R. B.， Zhou R.， Halgren T. A.， J. Comput. Chem.， 2002， 23（16）， 1515—1531
|
| 12 |
Cisneros G. A.， Karttunen M.， Ren P.， Sagui C.， Chem. Rev.， 2014， 114（1）， 779—814
|
| 13 |
Ponder J. M.， Wu C.， Ren P.， Pande V. S.， Chodera J. D.， Schnieders M. J.， Haque I.， Mobley D. L.， Lambrechtar D. S.， DiStasio R. A. Jr.， Head⁃Gordon T.， J. Phys. Chem. B， 2010， 114（8）， 2549—2564
|
| 14 |
Stukan M. R.， Asmadi A.， Abdallah W.， J. Mol. Liq.， 2013， 180， 65—69
|
| 15 |
Lemkul J. A.， Huang J.， Roux B.， MacKerell A. D. Jr.， Chem. Rev.， 2016， 116（9）， 4983—5013
|
| 16 |
Patel S.， Brooks C. L.， J. Comput. Chem.， 2004， 25（1）， 1—16
|
| 17 |
Patel S.， MacKerell Jr A. D.， Brooks C. L.， J. Comput. Chem.， 2004， 25（12）， 1504—1514
|
| 18 |
Li S. S.， Huang C. Y.， Hao J. J.， Wang C. S.， J. Comput. Chem.， 2014， 35（6）， 415—426
|
| 19 |
Hao J. J.， Wang C. S.， RSC Adv.， 2015， 5（9）， 6452—6461
|
| 20 |
Gao X. C.， Hao Q.， Wang C. S.， J. Chem. Theory Comput.， 2017， 13（6）， 2730—2741
|
| 21 |
Li X. L.， Sun Y. J.， Tang Y.， Wang C. S.， Chem. J. Chinese Universities， 2021， 42（12）， 3664—3671
|
|
李晓蕾， 孙云娇， 唐颖， 王长生. 高等学校化学学报， 2021， 42（12）， 3664—3671
|
| 22 |
Li X. L.， Li C. M.， Zhu J. Y.， Zhou Z.， Hao Q.， Wang C. S.， J. Comput. Chem.， 2023， 44（5）， 677—686
|
| 23 |
Jankiewicz W.， Podeszwa R.， Witek H. A.， J. Chem. Theory Comput.， 2019， 14（10）， 5079—5089
|
| 24 |
Góra U.， Podeszwa R.， Cencek W.， Szalewicz K.， J. Chem. Phys.， 2011， 135（22）， 224102
|
| 25 |
James G. S.， Lange's Handbook of Chemistry， 16th Edition， McGraw⁃Hill， New York， 2005， Chapter 1.8， 171
|
| 26 |
Hickey A. L.， Rowley C. N.， J. Phys. Chem. A， 2014， 118（20）， 3678—3687
|
| 27 |
Haynes W. M.， CRC Handbook of Chemistry and Physics， 97th Edition， CRC Press， Boca Raton， 2016， Chapter 9， 60—66
|
| 28 |
Jiao D.， Golubkov P.A.， Darden T. A.， Ren P.， Proc. Natl. Acad. Sci. USA， 2008， 105（17）， 6290—6295
|
| 29 |
Rackers J. A.， Zhi W.， Liu C.， Laury M. L.， Lagardere L.， Schnieders M. J.， Piquemal J. P.， Ren P.， Ponder J. M.， J. Chem. Theory Comput.， 2018， 14（10）， 5273—5289
|
| 30 |
Shi Y.， Xia Z.， Zhang J.， Best R.， Wu C.， Ponder J. M.， Ren P.， J. Chem. Theory Comput.， 2013， 9（9）， 4046—4063
|
| 31 |
Zhang C. S.， Chao L.， Jing， Z. F.， Wu C. J.， Piquemal J. P.， Ponder J. M.， Ren P.， J. Chem. Theory Comput.， 2018， 14（4）， 2084—2108
|
), 王长生(
