Chem. J. Chinese Universities ›› 2021, Vol. 42 ›› Issue (11): 3321.doi: 10.7503/cjcu20210420
• Review • Previous Articles Next Articles
LIU Hong1, JIANG Jinghong2, DUAN Zhijuan1, XU Shijun1, HUANG Fujian1(), XIA Fan1
Received:
2021-06-21
Online:
2021-11-10
Published:
2021-08-18
Contact:
HUANG Fujian
E-mail:huangfj@cug.edu.cn
Supported by:
CLC Number:
TrendMD:
LIU Hong, JIANG Jinghong, DUAN Zhijuan, XU Shijun, HUANG Fujian, XIA Fan. Recent Advance in Light-controlled CRISPR Technology[J]. Chem. J. Chinese Universities, 2021, 42(11): 3321.
1 | Zhao Z. W., Ma Q., Ma L. N., Wang J., Wang X. W., Li Y. K., Journal of Ningxia University(Natural Science Edition), 2021, 42(2), 184—191(赵正伟, 马青, 马丽娜, 王锦, 王晓薇, 李颖康. 宁夏大学学报: 自然科学版, 2021, 42(2), 184—191) |
2 | Kang X. L., Chu D. D., Shan B., World Notes on Antibiotics,2020, 41(1), 35—41(康细林, 储丹丹, 单斌. 国外医药(抗生素分册), 2020, 41(1), 35—41) |
3 | Marraffini L. A., Nature., 2015, 526(7571), 55—61 |
4 | Amitai G., Sorek R., Nat. Rev. Microbiol., 2016, 14(2), 67—76 |
5 | Anzalone A. V., Koblan L. W., Liu D. R., Nat. Biotechnol., 2020, 38(7), 824—844 |
6 | Salsman J., Dellaire G., Biochem. Cell Biol., 2017, 95(2), 187—201 |
7 | Modell A. E., Siriwardena S. U., Shoba V. M., Li X., Choudhary A., Curr. Opin. Chem. Biol., 2021, 60, 113—121 |
8 | Javed M. R., Sadaf M., Ahmed T., Jamil A., Nawaz M., Abbas H., Ijaz A., Curr. Microbiol., 2018, 75(12), 1675—1683 |
9 | Zhang J., Chen L., Zhang J., Wang Y., Comput. Struct. Biotechnol. J., 2019, 17, 1171—1177 |
10 | Hryhorowicz M., Grześkowiak B., Mazurkiewicz N., Śledziński P., Lipiński D., Słomski R., Mol. Biotechnol., 2019, 61(3), 173—180 |
11 | Moroz⁃Omori E. V., Satyapertiwi D., Ramel M. C., Høgset H., Sunyovszki I. K., Liu Z., Wojciechowski J. P., Zhang Y., Grigsby C. L., Brito L., Bugeon L., Dallman M. J., Stevens M. M., ACS Cent Sci., 2020, 6(5), 695—703 |
12 | Zhang D., Tang B., Xie X., Xiao Y. F., Yang S. M., Zhang J. W., Cancer Biol. Ther., 2015, 16(7), 1005—1013 |
13 | Pawelczak K. S., Gavande N. S., VanderVere⁃Carozza P. S., Turchi J. J., ACS Chem. Biol., 2018, 13(2), 389—396 |
14 | Carroll D., Yale J. Biol. Med., 2017, 90(4), 653—659 |
15 | Gaj T., Gersbach C. A., Barbas C. F., 3rd Trends Biotechnol., 2013, 31(7), 397—405 |
16 | Urnov F. D., Rebar E. J., Holmes M. C., Zhang H. S., Gregory P. D., Nat. Rev. Genet., 2010, 11(9), 636—646 |
17 | Gupta D., Bhattacharjee O., Mandal D., Sen M. K., Dey D., Dasgupta A., Kazi T. A., Gupta R., Sinharoy S., Acharya K., Chattopadhyay D., Ravichandiran V., Roy S., Ghosh D., Life Sci., 2019, 232, 116636 |
18 | Koonin E. V., Makarova K. S., Zhang F., Curr. Opin. Microbiol., 2017, 37, 67—78 |
19 | Koonin E. V., Makarova K. S., Philos. Trans R Soc. Lond B Biol. Sci., 2019, 374(1772), 20180087 |
20 | Barman A., Deb B., Chakraborty S., Curr. Genet., 2020, 66(3), 447—462 |
21 | Ran F. A., Hsu P. D., Wright J., Agarwala V., Scott D. A., Zhang F., Nat. Protoc., 2013, 8(11), 2281—2308 |
22 | Jiang F., Doudna J. A., Annu. Rev. Biophys., 2017, 46, 505—529 |
23 | Shen B., Zhang W., Zhang J., Zhou J., Wang J., Chen L., Wang L., Hodgkins A., Iyer V., Huang X., Skarnes W. C., Nat. Methods, 2014, 11(4), 399—402 |
24 | Brocken D., Tark⁃Dame M., Dame R. T., Curr. Issues Mol. Biol., 2018, 26, 15—32 |
25 | Kleinstiver B. P., Pattanayak V., Prew M. S., Tsai S. Q., Nguyen N. T., Zheng Z., Joung J. K., Nature., 2016, 529(7587), 490—495 |
26 | Gao P., Lyu Q., Ghanam A. R., Lazzarotto C. R., Newby G. A., Zhang W., Choi M., Slivano O. J., Holden K., Walker J. A., 2nd Kadina A. P., Munroe R. J., Abratte C. M., Schimenti J. C., Liu D R., Tsai S. Q., Long X., Miano J. M., Genome Biol., 2021, 22(1), 83 |
27 | Moghadam F., LeGraw R., Velazquez J. J., Yeo N. C., Xu C., Park J., Chavez A., Ebrahimkhani M. R., Kiani S., Nat. Cell Biol., 2020, 22(9), 1143—1154 |
28 | Zhan T., Rindtorff N., Betge J., Ebert M. P., Boutros M., Semin. Cancer Biol., 2019, 55, 106—119 |
29 | Zhang Y., Ma X., Xie X., Liu Y. G., Prog. Mol. Biol. Transl. Sci., 2017, 149, 133—150 |
30 | Swarts D. C., van der Oost J., Jinek M., Mol. Cell., 2017, 66(2), 221—233 |
31 | Stella S., Alcón P., Montoya G., Nature, 2017, 546(7659), 559—563 |
32 | Safari F., Zare K., Negahdaripour M., Barekati⁃Mowahed M., Ghasemi Y., Cell Biosci., 2019, 9, 36 |
33 | Fonfara I., Richter H., Bratovič M., Le Rhun A., Charpentier E., Nature, 2016, 532(7600), 517—521 |
34 | Moreno⁃Mateos M. A., Fernandez J. P., Rouet R., Vejnar C. E., Lane M. A., Mis E., Khokha M. K., Doudna J. A., Giraldez A. J., Nat. Commun., 2017, 8(1), 2024 |
35 | Campa C. C., Weisbach N. R., Santinha A. J., Incarnato D., Platt R. J., Nat. Methods, 2019, 16(9), 887—893 |
36 | Li T., Zhu L., Xiao B., Gong Z., Liao Q., Guo J., Biotechnol. Adv., 2019, 37(1), 21—27 |
37 | Liu Q., Zhang Y., Li F., Li J., Sun W., Tian C., Biotechnol. Biofuels, 2019, 12, 293 |
38 | Ding X., Yin K., Li Z., Liu C., bioRxiv., 2020, 2020.03.19.998724 |
39 | Dai Y., Somoza R. A., Wang L., Welter J. F., Li Y., Caplan A. I., Liu C. C., Angew. Chem. Int. Ed. Engl.,2019, 58(48), 17399—17405 |
40 | Liu L., Li X., Wang J., Wang M., Chen P., Yin M., Li J., Sheng G., Wang Y., Cell, 2017, 168(1/2), 121—134 |
41 | East⁃Seletsky A., O'Connell M. R., Knight S. C., Burstein D., Cate J. H., Tjian R., Doudna, J. A., Nature, 2016, 538(7624), 270—273 |
42 | O'Connell M. R., J. Mol. Biol., 2018, 431(1), 66—87 |
43 | Abudayyeh O. O., Gootenberg J. S., Essletzbichler P., Han S., Joung J., Belanto J. J., Verdine V., Cox D., Kellner M. J., Regev A., Lander E. S., Voytas D. F., Ting A. Y., Zhang F., Nature, 2017, 550(7675), 280—284 |
44 | Gootenberg J. S., Abudayyeh O. O., Lee J. W., Essletzbichler P., Dy A. J., Joung J., Verdine V., Donghia N., Daringer N. M., Freije C. A., Myhrvold C., Bhattacharyya R. P., Livny J., Regev A., Koonin E. V., Hung D. T., Sabeti P. C., Collins J. J., Zhang F., Science, 2017, 356(6336), 438—442 |
45 | Jing X., Xie B., Chen L., Zhang N., Jiang Y., Qin H., Wang H., Hao P., Yang S., Li X., Nucleic Acids Res., 2018, 46(15), e90 |
46 | Zhao X., Liu L., Lang J., Cheng K., Wang Y., Li X., Shi J., Wang Y., Nie G., Cancer Lett., 2018, 431, 171—181 |
47 | Palaz F., Kalkan A. K., Can Ö., Demir A. N., Tozluyurt A., Özcan A., Ozsoz M., ACS Synth. Biol., 2021, 10(6), 1245—1267 |
48 | Silva J. M., Silva E., Reis R. L. J. Control Release, 2019, 298, 154—176 |
49 | Ricken J., Medda R., Wegner S. V., Adv. Biosyst., 2019, 3(3), e1800302 |
50 | Ahmed I., Fruk L., Mol. Biosyst., 2013, 9(4), 565—570 |
51 | Mayer G., Heckel A., Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2006, 45(30), 4900—4921 |
52 | Ellis-Davies G. C., Nat. Methods, 2007, 4(8), 619—628 |
53 | Yu H., Li J., Wu D., Qiu Z., Zhang Y., Chem. Soc. Rev., 2010, 39(2), 464—473 |
54 | Klán P., Šolomek T., Bochet C. G., Blanc A., Givens R., Rubina M., Popik V., Kostikov A., Wirz J., Chem. Rev., 2013, 113(1), 119—191 |
55 | Casey J. P., Blidner R. A., Monroe W. T., Mol. Pharm., 2009, 6(3), 669—685 |
56 | Brieke C., Rohrbach F., Gottschalk A., Mayer G., Heckel A., Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2012, 51(34), 8446—8476 |
57 | Hager S., Fittler F. J., Wagner E., Bros M., Cells, 2020, 9(9), 2061 |
58 | Chaulk S. G., MacMillan A. M., Nat. Protoc., 2007, 2(5), 1052—1058 |
59 | Young D. D., Edwards W. F., Lusic H., Lively M. O., Deiters A., Chem. Commun.(Camb)., 2008, (4), 462—464 |
60 | Mikat V., Heckel A., RNA, 2007, 13(12), 2341—2347 |
61 | Bardhan A., Deiters A., Ettensohn C. A., Dev. Biol., 2021, 475, 21—29 |
62 | Huang F., You M., Han D., Xiong X., Liang H., Tan W., J. Am. Chem. Soc., 2013, 135(21), 7967—7973 |
63 | Huang F., Lin M., Duan R., Lou X., Xia F., Willner I., Nano Lett., 2018, 18(8), 5116—5123 |
64 | Duan R., Li T., Duan Z., Huang F., Xia F., Anal. Chem., 2020, 92(8), 5846—5854 |
65 | Huang F., Liao W. C., Sohn Y. S., Nechushtai R., Lu C. H., Willner I., J. Am. Chem. Soc., 2016, 138(28), 8936—8945 |
66 | Huang F., Duan R., Zhou Z., Vázquez-González M., Xia F., Willner I.,Chem. Sci., 2020, 11(21), 5592—5600 |
67 | Huang F., Xu H., Tan W., Liang H., ACS Nano, 2014, 8(7), 6849—6855 |
68 | Huang F., Zhou X., Yao D., Xiao S., Liang H., Small, 2015, 11(43), 5800—5806 |
69 | Huang F., Zhang J., Li T., Duan R., Xia F., Willner I., Nano Lett., 2019, 19(1), 618—625 |
70 | Tallafuss A., Gibson D., Morcos P., Li Y., Seredick S., Eisen J., Washbourne P., Development, 2012, 139(9), 1691—1699 |
71 | Shestopalov I. A., Sinha S., Chen J. K., Nat. Chem. Biol., 2007, 3(10), 650—651 |
72 | Tang X., Swaminathan J., Gewirtz A. M., Dmochowski I. J., Nucleic Acids Res., 2008, 36(2), 559—569 |
73 | Jain P. K., Shah S., Friedman S. H., J. Am. Chem. Soc., 2011, 133(3), 440—446 |
74 | Govan J. M., Uprety R., Hemphill J., Lively M. O., Deiters A., ACS Chem. Biol., 2012, 7(7), 1247—1256 |
75 | Hemphill J., Govan J., Uprety R., Tsang M., Deiters A., J. Am. Chem. Soc., 2014, 136(19), 7152—7158 |
76 | Baker A. S., Deiters A., ACS Chem Biol., 2014, 9(7), 1398—1407 |
77 | Liu Q., Tucker C. L. Curr. Opin. Chem. Biol., 2017, 40, 17—23 |
78 | Baker A. S., Deiters A., ACS Chem. Biol., 2014, 9(7), 1398—1407 |
79 | Yazawa M., Sadaghiani A. M., Hsueh B., Dolmetsch R. E., Nat. Biotechnol., 2009, 27(10), 941—945 |
80 | Crefcoeur R. P., Yin R., Ulm R., Halazonetis T. D., Nat. Commun., 2013, 4, 1779 |
81 | Müller K., Engesser R., Metzger S., Schulz S., Kämpf M. M., Busacker M., Steinberg T., Tomakidi P., Ehrbar M., Nagy F., Timmer J., Zubriggen M. D., Weber W., Nucleic Acids Res., 2013, 41(7), e77 |
82 | Kennedy M. J., Hughes R. M., Peteya L. A., Schwartz J. W., Ehlers M. D., Tucker C. L., Nat. Methods, 2010,7(12), 973—975 |
83 | Arbely E., Torres⁃Kolbus J., Deiters A., Chin J. W., J. Am. Chem. Soc., 2012, 134(29), 11912—11915 |
84 | Gautier A., Nguyen D. P., Lusic H., An W., Deiters A., Chin J. W., J. Am. Chem. Soc., 2010, 132(12), 4086—4088 |
85 | Hemphill J., Chou C., Chin J. W., Deiters A., J. Am. Chem. Soc., 2013, 135(36), 13433—13439 |
86 | Luo J., Arbely E., Zhang J., Chou C., Uprety R., Chin J. W., Deiters A., Chem. Commun.(Camb)., 2016, 52(55), 8529—8532 |
87 | Ren W., Ji A., Ai H. W., J. Am. Chem. Soc., 2015, 137(6), 2155—2158 |
88 | Barman A., Deb B., Chakraborty S., Curr. Genet., 2020, 66(3), 447—462 |
89 | Swarts D. C., Jinek M., Wiley Interdiscip Rev. RNA, 2018, e1481 |
90 | Pan Y., Yang J., Luan X., Liu X., Li X., Yang J., Huang T., Sun L., Wang Y., Lin Y., Song Y., Sci. Adv., 2019, 5(4), eaav7199 |
91 | Moroz⁃Omori E. V., Satyapertiwi D., Ramel M. C., Høgset H., Sunyovszki I. K., Liu Z., Wojciechowski J. P., Zhang Y., Grigsby C. L., Brito L., Bugeon L., Dallman M. J., Stevens M. M., ACS Cent. Sci., 2020, 6(5), 695—703 |
92 | Zhang Y., Ling X., Su X., Zhang S., Wang J., Zhang P., Feng W., Zhu Y. Y., Liu T., Tang X., Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2020, 59(47), 20895—20899 |
93 | Aksoy Y. A., Yang B., Chen W., Hung T., Kuchel R. P., Zammit N. W., Grey S. T., Goldys E. M., Deng W., ACS Appl. Mater. Interfaces, 2020, 12(47), 52433—52444 |
94 | Nihongaki Y., Kawano F., Nakajima T., Sato M., Nat. Biotechnol., 2015, 33(7), 755—760 |
95 | Yu Y., Wu X., Guan N., Shao J., Li H., Chen Y., Ping Y., Li D., Ye H., Sci. Adv., 2020, 6(28), eabb1777 |
96 | Hemphill J., Borchardt E. K., Brown K., Asokan A., Deiters A., J. Am. Chem. Soc., 2015, 137(17), 5642—5645 |
97 | Liu Y., Zou R. S., He S., Nihongaki Y., Li X., Razavi S., Wu B., Ha T., Science, 2020, 368(6496), 1265—1269 |
98 | Zhou W., Brown W., Bardhan A., Delaney M., Ilk A. S., Rauen R. R., Kahn S. I., Tsang M., Deiters A., Angew. Chem. Int. Ed. Engl.,2020, 59(23), 8998—9003 |
99 | Carlson-Stevermer J., Kelso R., Kadina A., Joshi S., Rossi N., Walker J., Stoner R., Maures T., Nat. Commun., 2020, 11(1), 5041 |
100 | Zhao J., Li B., Ma J., Jin W., Ma X., Small, 2020, 16(30), e1907301 |
101 | Qi F., Tan B., Ma F., Zhu B., Zhang L., Liu X., Li H., Yang J., Cheng B., Int. J. Biol. Sci., 2019, 15(8), 1630—1636 |
102 | Fan J., Liu Y., Liu L., Huang Y., Li X., Huang W., ACS Synth. Biol., 2019, 9(2), 343—355 |
103 | Fu Y., Foden J. A., Khayter C., Maeder M. L., Reyon D., Joung J. K., Sander J. D., Nat. Biotechnol., 2013, 31(9), 822—826 |
104 | Pattanayak V., Lin S., Guilinger J. P., Ma E., Doudna J. A., Liu D. R., Nat. Biotechnol., 2013, 31(9), 839—843 |
105 | Tsai S. Q., Zheng Z., Nguyen N. T., Liebers M., Topkar V. V., Thapar V., Wyvekens N., Khayter C., Iafrate A. J., Le L. P., Aryee M. J., Joung J. K., Nat. Biotechnol., 2015, 33(2), 187—197 |
106 | Slaymaker I. M., Gao L., Zetsche B., Scott D. A., Yan W. X., Zhang F., Science, 2016, 351(6268), 84—88 |
107 | Lin Y., Cradick T. J., Brown M. T., Deshmukh H., Ranjan P., Sarode N., Wile B. M., Vertino P. M., Stewart F. J., Bao G., Nucleic Acids Res., 2014, 42(11), 7473—7485 |
108 | Hsu P. D., Scott D. A., Weinstein J. A., Ran F. A., Konermann S., Agarwala V., Li Y., Fine E. J., Wu X., Shalem O., Cradick T. J., Marraffini L. A., Bao G., Zhang F., Nat. Biotechnol., 2013, 31(9), 827—832 |
109 | Feldbauer K., Zimmermann D., Pintschovius V., Spitz J., Bamann C., Bamberg E., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2009, 106(30), 12317—12322 |
110 | Lu Y., Xue J., Deng T., Zhou X., Yu K., Deng L., Huang M., Yi X., Liang M., Wang Y., Shen H., Tong R., Wang W., Li L., Song J., Li J., Su X., Ding Z., Gong Y., Zhu J., Mok T., Nat. Med., 2020, 26(5), 732—740 |
111 | Maeder M. L., Stefanidakis M., Wilson C. J., Baral R., Barrera L. A., Bounoutas G. S., Bumcrot D., Chao H., Ciulla D. M., DaSilva J. A., Dass A., Dhanapal V., Fennell T. J., Friedland A. E., Giannoukos G., Gloskowski S. W., Glucksmann A., Gotta G. M., Jayaram H., Haskett S. J., Jiang H., Nat. Med., 2019, 25(2), 229—233 |
[1] | Jinhan Sheng, Qizhen Zheng, Ming Wang. Non-viral delivery of CRISPR/Cas9 Genome Editing [J]. Chem. J. Chinese Universities, 2022, 43(Album-4): 20220344. |
Viewed | ||||||
Full text |
|
|||||
Abstract |
|
|||||